イオとの死闘を制したダリルは、ジオン殘黨軍の一員として地球にいた。彼は奪われたサイコ?ザクの情報を得るための諜報任務(wù)に就いていたのだ。一方、新たな仲間と共に「サンダーボルト作戦」に參加したイオの前に、南洋同盟國境守備隊隊長を名乗るペール中佐が立ち塞がる。海中で、氷原で、密林で繰り広げられる、ジオン、連邦、南洋同盟、三つ巴のモビルスーツ戦。戦爭はまだ、終わってはいなかった――。